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Cyril Soucaille
Faculté des Sciences et Techniques
Cyril Soucaille

Né le 15 février 1979

Bioinformaticien
ExonHit Therapeutics


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Peux-tu nous décrire ton entreprise ?

ExonHit est une société de biotechnologies basée à Paris, dont le siège se trouve dans le XVIIème arrondissement et les laboratoires dans le XIIIème (ExonHit Therapeutics SA). Une filiale est en place aux USA, à Gaithersburg (ExonHit Therapeutics Inc.). La société a été fondée en 1997 par trois chercheurs de Rhône-Poulenc. Son chiffre d'affaires pour l'année 2007 est d'environ 5,3 millions d'euro et le nombre d'employés (France + USA) est d'environ 70. ExonHit est cotée en bourse sur le marché Euronext depuis fin 2006.

La Société s'est spécialisée, au départ, dans la mise au point d'une méthode d'analyse des événements d'épissage alternatif afin de détecter d'éventuelles 'versions' de gènes impliquées dans une pathologie donnée. Aujourd'hui, l'activité s'est élargie aussi bien vers la mise au point de composés chimiques que de méthodes informatiques de composition de puces à ADN basées sur l'épissage alternatif. Les puces à ADN sont hybridées a des fragments d'ADN de patients, afin de visualiser les profils d'expressions des gènes. De cette manière, il est possible de savoir quel gène peut être impliqué dans le développement de pathologies ciblées. Les différents axes de Recherches et Développement visent donc la mise au point de composés thérapeutiques et le ciblage de gènes impliqués dans certaines pathologies (maladie dAlzheimer, cancer du sein...).

Je suis développeur informatique dans une équipe de quatre personnes: analyse de données, statistiques, système d'information / réseau et développement. Je m'occupe principalement de bases de données. Le travail consiste en la modélisation et le stockage de données biologiques issues d'épissage alternatif pour la constitution de puces à ADN. Un traitement post-stockage (statistiques, ciblage de données particulières) peut intervenir soit directement dans la modélisation des bases soit par le biais de programmes s'appuyant sur les données issues des bases. Parallèlement à ceci, il faut pouvoir répondre au jour le jour aux problématiques exposées par les équipes de Recherche, afin de développer des programmes permettant de les aider. Des connaissances biologiques sont donc indispensables dans la compréhension des différentes problématiques.

Si le rôle du bioinformaticien est essentiellement le développement de programmes informatiques, celui-ci peut également intervenir dans le support informatique, la mise en place de réseaux et de logiciels, ainsi que le diagnostic de problèmes informatiques (logiciels ou matériels). Un spectre large de compétences est généralement requis au sein d'une entreprise de taille modeste, tablant sur la multidisciplinarité.


Quel est ton salaire annuel ?

40 000 euro par an.


Quel a été ton parcours universitaire ?

J'ai effectué mon cursus d'Ecologie (DEUG -> Maîtrise) à Corte entre 1997 et 2002. Suite à la Maîtrise, étant assez passionné d'informatique, je me suis intéressé au domaine la Bioinformatique qui en était à ses balbutiements, en France, à l'époque. La Bioinformatique est une discipline multidisciplinaire permettant de relier la Biologie (mais aussi les Biomathématiques, Biostatistiques et Physique) et l'informatique. Son but est de modéliser des problématiques Biologiques afin de les résoudre. L'augmentation exponentielle de la quantité de données à traiter implique une utilisation intensive des bases de données, en plus d'une programmation informatique plus 'classique'.
Souhaitant intégrer une formation professionnalisante de type Bac +5 et avoir une expérience en dehors de la Corse, j'ai fait le tour des DESS existant sur le Continent. Je n'ai pas pu intégrer directement ces formations en raison de l'absence de module informatique dans mon cursus. J'ai donc effectué un DU d'Informatique Scientifique à Lyon, qui m'a ensuite permis d'être reçu au DESS de Bioinformatique de Toulouse. Suite au DESS, j'ai effectué un stage de 6 mois au sein d'Aventis Pasteur à Lyon (devenue Sanofi Pasteur depuis) suivi d'un contrat d'un an, au cours duquel j'ai dirigé en tant qu'intérimaire le poste de responsable du pôle Bioinformatique.


Et si c'était à refaire ?

Si c'était à refaire, je referais tout pareil :-)
Corte dispose d'un climat de travail exceptionnel et d'un enseignement de qualité. Pour parler de ce que je connais, je sais par expérience que la formation en Biologie est suffisamment étoffée pour pouvoir aborder beaucoup de problématiques en Biologie (Moléculaire, Génétique, Ecologie...). Le seul reproche que je pourrais faire est le manque de représentation de l'Université de Corse auprès des scientifiques du Continent qui oblige à se sur-justifier sur la qualité de l'enseignement, et le manque de partenariats avec les labos / entreprises. Cette lacune en terme de partenariats conduit inévitablement à devoir effectuer une recherche exhaustive et à faire ses preuves par la suite auprès des professionnels du domaine. Je suis parti de Corse en partie afin de me constituer une expérience ailleurs, mais également par nécessité, le secteur dans lequel je travaille étant inexistant en Corse, dans le domaine privé tout du moins.

Le conseil que je donnerais aux 1ers cycles intéressés par la Bioinformatique: le secteur n'est pas aussi florissant que beaucoup d'Universités le prétendent. Le marché du travail est actuellement assez amorphe. Si vous êtes intéressés par le milieu de l'Entreprise, une formation professionnalisante (Bac +5) est, à mon sens, préférable à un doctorat, l'expérience s'acquière essentiellement sur le terrain et les entreprises préfèrent ces profils. Il faut être conscient que la plupart des postes en milieu d'Entreprise sont situés à l'étranger. La plupart des propositions de postes en France émanent du secteur public. Ce sont généralement des CDD à répétition, rémunérés faiblement.
Avant de se lancer sur un quelconque marché, prendre la température du moment et la tendance évolutive. Pour la Bioinformatique, chercher les associations (Société Française de Bioinformatique par exemple) afin de poser des questions à des gens qui ont réellement un pied dans cet activité. Si en revanche vous souhaitez vous constituer une expérience à l'étranger, il est possible sans mal de trouver des postes dans le secteur privé en Suisse, Angleterre, Irlande, USA, Canada ou dans des pays émergents comme l'Inde ou la Chine. Les salaires proposés aux USA, Angleterre ou Suisse par exemple sont plus qu'intéressants. Ne pas oublier de se renseigner sur le coût de la vie (logement surtout) par rapport au salaire proposé.

Malgré le contexte actuel, la Bioinfomatique est un domaine passionnant dans lequel il est possible de rencontrer des gens extrêmement intéressants et de faire un travail varié, multidisciplinaire. Un point non négligeable est également que la double compétence Biologie / Informatique permet de jouer sur les deux tableaux et d'intégrer également le domaine Informatique pur. Il faut savoir que beaucoup d'entreprises privilégient actuellement des profils Bac +5 informatique qui ne sont pas forcément issus d'école d'ingénieurs. La préférence va aux 'têtes bien faites' (ce sont leur propre terme) qui ont montré une grande capacité d'adaptation, élément clé de l'évolution des entreprises actuelles. Il y a donc de nombreuses manières d'évoluer en ne cessant d'apprendre par le biais de cette filière.

Témoignage recueilli par Marie-Hélène Pancrazi - Geronimi


Page mise à jour le 06/02/2012 à 16:20


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