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Depuis de nombreuses années, l’Université de Corse a fait des choix stratégiques qui se sont traduits par une volonté de structuration de la recherche. Cet effort a conduit à des regroupements et à une diminution du nombre de laboratoires.
Aujourd’hui l’université possède un dispositif de recherche composé de 3 entités labellisées par le CNRS regroupant des enseignants-chercheurs universitaires et des chercheurs permanents du CNRS :
· L'UMR-CNRS n°6134 "Sciences Pour l’Environnement" (SPE) ;
· L’UMR-CNRS n°6240 "Lieux, Identités, eSpaces, Activités" (LISA) ;
· La Fédération de Recherche CNRS n°3041 "Environnement et Société" (FRES).
Les 2 laboratoires de recherche mixtes (UMR-CNRS) se structurent autour de sept projets de recherche structurants qui correspondent à des secteurs à fort potentiel de développement au niveau international :
· Feux de forêts
· Énergies Renouvelables
· Ressources Naturelles
· Gestion et Valorisation des Eaux en Méditerranée
· Technologies de l’Information et de la Communication
· Dynamiques des Territoires et Développement Durable
· Identités, Cultures : les processus de patrimonialisation
et la Fédération de Recherche est chargée du développement de projets pluridisciplinaires associant des chercheurs des 2 UMR et d’autres organismes de recherche (INRA, INSERM, …).
Par ailleurs, les unités de recherche s’intègrent dans l’école doctorale "Environnement et Société" (ED n°377) qui constitue la structure pédagogique au sein de laquelle les étudiants en master ou en doctorat s’initient aux méthodes propres à leur discipline.
Enfin, l’Université dispose d’un institut, l’institut d’études scientifiques de Cargèse, qui est une unité mixte de service également labellisée par le CNRS (UMS-CNRS n°820), et dont le rôle est d’organiser des écoles scientifiques internationales de haut niveau.
L’Université compte également une Équipe de Recherche Technologique (ERT) Aspects juridiques du patrimoine des personnes physiques et des entreprises. | 
